Selkämeren saaristossa on useitä saaria, jotka sopivat retkikohteiksi. Monilla näistä saarista on ollut sota-ajan linnakkeita. Myös moni majakkasaari on avannut porttinsa retkeilijöille. Osaan majakoista pääsee sisään opastetulla retkellä.
Useisiin kohteisiin järjestetään venekuljetuksia, myös Metsähallituksen yhteistyöyrittäjät tarjoavat tilauksesta veneretkiä saariin. Kaikki kohteet ovat tavoitettavissa omalla veneellä tai kanootilla. Osalla saarista voi myös yöpyä.
Hamskeri
Iso-Enskeri
Isokari
Katanpään linnakesaari
Kuuskajaskari
Kylmäpihlaja
Munakari
Seliskeri
Säppi
Vähä-Haurunen